La FFAP désigne ses représentants dans les organismes suivants :
- Commission Paritaire des Publications et Agences de Presse - CPPAP
7 membres titulaires et 7 suppléants
- Commission de la carte d'identité des journalistes - CCIJP
1 membre titulaire
- Commission arbitrale des journalistes
2 arbitres sur 5 dans toutes les affaires concernant les agences de presse
- Écoles de journalisme
1 membre dans les conseils pédagogiques ou dans les conseils d’administration de toutes les écoles reconnues par la Convention collective
- Groupe Audiens
1 membre au Conseil d'administration
- AFDAS
1 membre au Conseil d'administration - suppléant
1 membre au Conseil paritaire presse écrite agences
1 membre au Conseil de gestion CIF interbranches 1 membre au Conseil de gestion CIF presse écrite agences 1 membre au conseil de gestion pigiste
- Commission pour l'attribution des cartes de presse à l'Assemblée nationale
1 membre représentant les agences de presse
- Comité de liaison de la presse
1 membre
- Commission nationale paritaire de l'emploi des journalistes
1 membre
- Association pour la gestion de la sécurité sociale des auteurs
1 membre
Par ailleurs, les membres de la FFAP sont très souvent sollicités pour être arbitres dans les conflits qui opposent employeurs et employés à la Commission arbitrale des journalistes et dans les Commissions de conciliation.