La FFAP désigne ses représentants dans les organismes suivants :
- Commission Paritaire des Publications et Agences de Presse - CPPAP
7 membres titulaires et 7 suppléants
- Commission de la carte d'identité des journalistes - CCIJP
1 membre titulaire
- Ecoles de journalisme
1 membre dans les conseils pédagogiques ou dans les conseils d’administration de toutes les écoles reconnues par la Convention collective
- Caisse BELLINI
1 membre au Conseil d'administration
- Caisse GUTENBERG
1 membre au Conseil d'administration
- Mutuelle de la presse et du livre
1 membre au Conseil d'administration
- Médiafor
1 membre au Conseil d'administration
9 membres du collège employeur (sur 12) sont désignés par la FFAP dans la section " agences "
1 membre dans la section " entreprises de moins de 10 salariés "
- Commission pour l'attribution des cartes de presse à l'Assemblée nationale
1 membre représentant les agences de presse
- Comité de liaison de la presse
1 membre
- Commission nationale paritaire de l'emploi des journalistes
1 membre
- Association pour la gestion de la sécurité sociale des auteurs
1 membre
Par ailleurs, les membres de la FFAP sont très souvent sollicités pour être arbitres dans les conflits qui opposent employeurs et employés à la Commission arbitrale des journalistes et dans les Commissions de conciliation.